Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C2CD4AQ8NCU7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C2CD4AQ8NCU7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms