Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CNTD1Q8N815 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CNTD1Q8N815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNTD1Q8N815 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms