Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NELFCDQ8IXH7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NELFCDQ8IXH7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NELFCDQ8IXH7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms