Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCF2L2Q86YR7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCF2L2Q86YR7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCF2L2Q86YR7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms