Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
KRT28Q7Z3Y7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KRT28Q7Z3Y7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms