Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSSK4Q6SA08 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSSK4Q6SA08 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms