Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRNIPQ6NTE8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRNIPQ6NTE8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms