Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBAP2Q5T6F2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBAP2Q5T6F2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBAP2Q5T6F2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms