Protein–RNA interactions for Protein: Q1L5Z9

LONRF2, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF2Q1L5Z9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF2Q1L5Z9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LONRF2Q1L5Z9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms