Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC18A3Q16572 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC18A3Q16572 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC18A3Q16572 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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