Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SS18Q15532 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18Q15532 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SS18Q15532 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SS18Q15532 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SS18Q15532 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SS18Q15532 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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