Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALCOCO2Q13137 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALCOCO2Q13137 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms