Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YMR111CYMR111C 1389 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 RAD30YDR419W 1899 nt4.52□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PEX29YDR479C 1665 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 MNT2YGL257C 1677 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 IPI3YNL182C 1668 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 EMP46YLR080W 1335 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 OAF1YAL051W 3144 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 STP4YDL048C 1473 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 NUS1YDL193W 1128 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 ZRT1YGL255W 1131 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 TFA2YKR062W 987 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YBL094CYBL094C 333 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YOL166CYOL166C 339 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 CDC6YJL194W 1542 nt4.51□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 STV1YMR054W 2673 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SMF1YOL122C 1728 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 GLN4YOR168W 2430 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YCL068CYCL068C 783 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YDR336WYDR336W 945 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YGR149WYGR149W 1299 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 MRPS35YGR165W 1038 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YRA2YKL214C 612 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 TDA5YLR426W 981 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 MRPL39YML009C 213 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 CDC21YOR074C 915 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 TMA16YOR252W 537 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 GMC1YDR506C 1827 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PRP43YGL120C 2304 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 TGL4YKR089C 2733 nt4.5□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PGM2YMR105C 1710 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 TPO2YGR138C 1845 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YDR290WYDR290W 330 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 IMP3YHR148W 552 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YAE1YJR067C 426 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YLL047WYLL047W 384 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 ORM2YLR350W 651 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PSY3YLR376C 729 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YMR178WYMR178W 825 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YNL134CYNL134C 1131 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YNL296WYNL296W 315 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 GPR1YDL035C 2886 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 VHC1YBR235W 3363 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SRS2YJL092W 3525 nt4.49□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 HPR1YDR138W 2259 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 BCH2YKR027W 2298 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PCA1YBR295W 3651 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 STB3YDR169C 1542 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YDL027CYDL027C 1263 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YDR161WYDR161W 1164 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 AAH1YNL141W 1044 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 TEX1YNL253W 1269 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 IAH1YOR126C 717 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SUP35YDR172W 2058 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 RVB1YDR190C 1392 nt4.48□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SKG3YLR187W 3081 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 MAF1YDR005C 1188 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SUT1YGL162W 900 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PEX21YGR239C 867 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 SAE3YHR079C-A 276 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 CTL1YMR180C 963 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 PRX1YBL064C 786 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 GLO4YOR040W 858 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 POL31YJR006W 1464 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 VID22YLR373C 2706 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 ALE1YOR175C 1860 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 APC4YDR118W 1959 nt4.47□□□□□ -1.69
NMD4Q12129 CRT10YOL063C 2874 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SWI3YJL176C 2478 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 GZF3YJL110C 1656 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 LAC1YKL008C 1257 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 KTR2YKR061W 1278 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 DCS1YLR270W 1053 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 ATG33YLR356W 594 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 SLZ1YNL196C 897 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 INA17YPL099C 549 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 BMT2YBR141C 1014 nt4.46□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 DDI2YFL061W 678 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YFR045WYFR045W 930 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YJL028WYJL028W 336 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 EBP2YKL172W 1284 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 COG5YNL051W 1212 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 DDI3YNL335W 678 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 AIF1YNR074C 1137 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YOR314WYOR314W 330 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YMR196WYMR196W 3267 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PUT2YHR037W 1728 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 ABF1YKL112W 2196 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 KAR5YMR065W 1515 nt4.45□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 TDA3YHR009C 1572 nt4.44□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 PRM1YNL279W 1986 nt4.44□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 YIF1YNL263C 945 nt4.44□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 VPS68YOL129W 555 nt4.44□□□□□ -1.7
NMD4Q12129 GRX1YCL035C 333 nt4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.8 ms