Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FAM3AP98173 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FAM3AP98173 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms