Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GTF2IP78347 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2IP78347 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IP78347 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms