Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYP4F2P78329 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYP4F2P78329 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F2P78329 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F2P78329 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F2P78329 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F2P78329 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F2P78329 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYP4F2P78329 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms