Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABCE1P61221 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABCE1P61221 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms