Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMP3P54852 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMP3P54852 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMP3P54852 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EMP3P54852 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMP3P54852 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EMP3P54852 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMP3P54852 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMP3P54852 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMP3P54852 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMP3P54852 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMP3P54852 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMP3P54852 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms