Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCNFP41002 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCNFP41002 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCNFP41002 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNFP41002 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNFP41002 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNFP41002 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNFP41002 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCNFP41002 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCNFP41002 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCNFP41002 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNFP41002 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNFP41002 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNFP41002 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNFP41002 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms