Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HOXD10P28358 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HOXD10P28358 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HOXD10P28358 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms