Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMB4P28070 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMB4P28070 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms