Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYL1P12980 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LYL1P12980 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYL1P12980 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYL1P12980 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYL1P12980 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYL1P12980 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LYL1P12980 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYL1P12980 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms