Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGB3P05106 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB3P05106 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms