Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRPF40AO75400 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRPF40AO75400 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms