Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H7C0S8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H7C0S8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H7C0S8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H7C0S8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H7C0S8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H7C0S8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H7C0S8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H7C0S8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H7C0S8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H7C0S8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H7C0S8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms