Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BHMG1C9JSJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
BHMG1C9JSJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BHMG1C9JSJ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms