Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF3BA8MYP8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF3BA8MYP8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms