Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
LRP12Q9Y561 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LRP12Q9Y561 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms