Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EPB41L3Q9Y2J2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EPB41L3Q9Y2J2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EPB41L3Q9Y2J2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms