Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPSEQ9Y251 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPSEQ9Y251 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms