Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
APPL1Q9UKG1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APPL1Q9UKG1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms