Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGEF1Q9UJ41 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGEF1Q9UJ41 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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