Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZDHHC3Q9NYG2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZDHHC3Q9NYG2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZDHHC3Q9NYG2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms