Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF19Q9NS68 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF19Q9NS68 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms