Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC40A1Q9NP59 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC40A1Q9NP59 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC40A1Q9NP59 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms