Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PREBQ9HCU5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PREBQ9HCU5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PREBQ9HCU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms