Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SHARPINQ9H0F6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHARPINQ9H0F6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SHARPINQ9H0F6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms