Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RSG1Q9BU20 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RSG1Q9BU20 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.5 ms