Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EBF4Q9BQW3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EBF4Q9BQW3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EBF4Q9BQW3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms