Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NUDCD1Q96RS6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUDCD1Q96RS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms