Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SAMD8Q96LT4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD8Q96LT4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms