Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLMNQ96JQ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLMNQ96JQ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms