Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH5

SOCS4, Suppressor of cytokine signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS4Q8WXH5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOCS4Q8WXH5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOCS4Q8WXH5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SOCS4Q8WXH5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms