Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC13A3Q8WWT9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC13A3Q8WWT9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms