Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LINC00301Q8NCQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LINC00301Q8NCQ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LINC00301Q8NCQ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms