Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDCD7Q8N8D1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD7Q8N8D1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 312.3 ms