Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC82Q8N4S0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC82Q8N4S0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms