Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM139Q8IV31 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM139Q8IV31 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMEM139Q8IV31 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms