Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BHLHA9Q7RTU4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BHLHA9Q7RTU4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BHLHA9Q7RTU4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms