Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND1BQ6P3S1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND1BQ6P3S1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND1BQ6P3S1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.2 ms